MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 chromosome

Total Repeats: 88123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017559	GAC	2	6	430	435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408233
2	NC_017559	AACGAT	2	12	460	471	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	523408233
3	NC_017559	GCG	2	6	488	493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408233
4	NC_017559	CAA	2	6	524	529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408233
5	NC_017559	CGC	2	6	555	560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408233
6	NC_017559	CGA	2	6	568	573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408233
7	NC_017559	TGC	2	6	585	590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408233
8	NC_017559	TCGC	2	8	656	663	0 %	25 %	25 %	50 %	523408233
9	NC_017559	ACT	2	6	669	674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408233
10	NC_017559	CCG	2	6	714	719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408233
11	NC_017559	GCC	2	6	731	736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408233
12	NC_017559	CGATGC	2	12	756	767	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	523408233
13	NC_017559	GCTG	2	8	772	779	0 %	25 %	50 %	25 %	523408233
14	NC_017559	GC	3	6	801	806	0 %	0 %	50 %	50 %	523408233
15	NC_017559	CG	3	6	816	821	0 %	0 %	50 %	50 %	523408233
16	NC_017559	GCCC	2	8	830	837	0 %	0 %	25 %	75 %	523408233
17	NC_017559	GCC	2	6	875	880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408233
18	NC_017559	GCG	2	6	884	889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408233
19	NC_017559	CGACAT	2	12	892	903	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	523408233
20	NC_017559	CGC	2	6	916	921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408233
21	NC_017559	GC	3	6	987	992	0 %	0 %	50 %	50 %	523408233
22	NC_017559	CGCC	2	8	993	1000	0 %	0 %	25 %	75 %	523408233
23	NC_017559	GC	4	8	1091	1098	0 %	0 %	50 %	50 %	523408233
24	NC_017559	GCC	2	6	1100	1105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408233
25	NC_017559	CAA	2	6	1117	1122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408233
26	NC_017559	CTGTAC	2	12	1145	1156	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	523408233
27	NC_017559	CG	5	10	1224	1233	0 %	0 %	50 %	50 %	523408233
28	NC_017559	CGA	2	6	1300	1305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408233
29	NC_017559	CTA	2	6	1315	1320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408233
30	NC_017559	CTG	3	9	1334	1342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408233
31	NC_017559	CGA	2	6	1345	1350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408233
32	NC_017559	TTC	2	6	1358	1363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408233
33	NC_017559	CGCA	2	8	1376	1383	25 %	0 %	25 %	50 %	523408233
34	NC_017559	GAA	2	6	1385	1390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408233
35	NC_017559	TTC	2	6	1391	1396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408233
36	NC_017559	CG	3	6	1424	1429	0 %	0 %	50 %	50 %	523408233
37	NC_017559	TCA	3	9	1434	1442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408233
38	NC_017559	CGA	2	6	1477	1482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408233
39	NC_017559	GCC	2	6	1528	1533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408233
40	NC_017559	TGA	2	6	1560	1565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408233
41	NC_017559	GGA	2	6	1597	1602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408233
42	NC_017559	CTT	2	6	1609	1614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408233
43	NC_017559	GC	3	6	1656	1661	0 %	0 %	50 %	50 %	523408233
44	NC_017559	CG	3	6	1719	1724	0 %	0 %	50 %	50 %	523408233
45	NC_017559	AGA	2	6	1782	1787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408233
46	NC_017559	ACA	2	6	1803	1808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408233
47	NC_017559	AAG	2	6	1832	1837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408233
48	NC_017559	CGGC	2	8	1838	1845	0 %	0 %	50 %	50 %	523408233
49	NC_017559	CG	3	6	1852	1857	0 %	0 %	50 %	50 %	523408233
50	NC_017559	AGA	2	6	1899	1904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408233
51	NC_017559	CGG	2	6	1930	1935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408233
52	NC_017559	ACCAC	2	10	1941	1950	40 %	0 %	0 %	60 %	523408233
53	NC_017559	TGC	2	6	1953	1958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408233
54	NC_017559	CGA	2	6	1978	1983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408233
55	NC_017559	GCA	2	6	1986	1991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408233
56	NC_017559	CTG	2	6	2355	2360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408234
57	NC_017559	GCC	2	6	2395	2400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408234
58	NC_017559	CTG	2	6	2424	2429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408234
59	NC_017559	TCCT	2	8	2454	2461	0 %	50 %	0 %	50 %	523408234
60	NC_017559	CAC	2	6	2486	2491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408234
61	NC_017559	GCG	2	6	2503	2508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408234
62	NC_017559	CCA	2	6	2527	2532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408234
63	NC_017559	GGC	2	6	2537	2542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408234
64	NC_017559	GC	3	6	2564	2569	0 %	0 %	50 %	50 %	523408234
65	NC_017559	CGCTCA	2	12	2590	2601	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	523408234
66	NC_017559	GCC	2	6	2658	2663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408234
67	NC_017559	GAA	2	6	2664	2669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408234
68	NC_017559	GC	4	8	2701	2708	0 %	0 %	50 %	50 %	523408234
69	NC_017559	AGA	2	6	2722	2727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408234
70	NC_017559	CTG	2	6	2739	2744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408234
71	NC_017559	CAG	2	6	2769	2774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408234
72	NC_017559	CTA	2	6	2783	2788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408234
73	NC_017559	TGC	2	6	2800	2805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408234
74	NC_017559	TGG	3	9	2806	2814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408234
75	NC_017559	GCG	2	6	2866	2871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408234
76	NC_017559	AGC	2	6	2884	2889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408234
77	NC_017559	CCG	2	6	2890	2895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408234
78	NC_017559	GCGG	2	8	2898	2905	0 %	0 %	75 %	25 %	523408234
79	NC_017559	TCA	2	6	2917	2922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408234
80	NC_017559	CTG	2	6	2955	2960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408234
81	NC_017559	CGA	2	6	2969	2974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408234
82	NC_017559	CG	3	6	3117	3122	0 %	0 %	50 %	50 %	523408234
83	NC_017559	GCA	2	6	3128	3133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408234
84	NC_017559	ACC	2	6	3159	3164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408234
85	NC_017559	CCA	2	6	3220	3225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408234
86	NC_017559	GAA	2	6	3237	3242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408234
87	NC_017559	GAA	2	6	3249	3254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408234
88	NC_017559	ACCT	2	8	3303	3310	25 %	25 %	0 %	50 %	523408234
89	NC_017559	GC	3	6	3376	3381	0 %	0 %	50 %	50 %	523408234
90	NC_017559	TCA	2	6	3382	3387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408234
91	NC_017559	GAC	3	9	3396	3404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408234
92	NC_017559	CGT	2	6	3416	3421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408234
93	NC_017559	CAG	2	6	3586	3591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408235
94	NC_017559	AGC	3	9	3616	3624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408235
95	NC_017559	GCC	2	6	3631	3636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408235
96	NC_017559	CAC	2	6	3721	3726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408235
97	NC_017559	CGA	2	6	3756	3761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408235
98	NC_017559	AGCGC	2	10	3884	3893	20 %	0 %	40 %	40 %	523408235
99	NC_017559	CGG	2	6	3924	3929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408235
100	NC_017559	GGC	2	6	3961	3966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408235
101	NC_017559	GGCGTG	2	12	3973	3984	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	523408235
102	NC_017559	CGTG	2	8	3986	3993	0 %	25 %	50 %	25 %	523408235
103	NC_017559	CG	4	8	4059	4066	0 %	0 %	50 %	50 %	523408235
104	NC_017559	CTG	2	6	4084	4089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408235
105	NC_017559	CGC	2	6	4130	4135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408235
106	NC_017559	CAC	2	6	4149	4154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408235
107	NC_017559	CGA	2	6	4188	4193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408235
108	NC_017559	AAC	2	6	4264	4269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408235
109	NC_017559	GACC	2	8	4287	4294	25 %	0 %	25 %	50 %	523408235
110	NC_017559	GAA	2	6	4309	4314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408235
111	NC_017559	GCG	2	6	4331	4336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408235
112	NC_017559	TCG	2	6	4346	4351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408235
113	NC_017559	CAA	2	6	4359	4364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408235
114	NC_017559	TGC	2	6	4376	4381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408235
115	NC_017559	TCT	2	6	4391	4396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408235
116	NC_017559	GGCGTG	2	12	4417	4428	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	523408235
117	NC_017559	ACG	2	6	4448	4453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408235
118	NC_017559	CAA	2	6	4482	4487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408235
119	NC_017559	CGG	2	6	4503	4508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408235
120	NC_017559	CACC	2	8	4509	4516	25 %	0 %	0 %	75 %	523408235
121	NC_017559	GC	3	6	4527	4532	0 %	0 %	50 %	50 %	523408235
122	NC_017559	CG	3	6	4541	4546	0 %	0 %	50 %	50 %	523408235
123	NC_017559	TCA	2	6	4547	4552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408235
124	NC_017559	CGA	2	6	4608	4613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408235
125	NC_017559	TCG	2	6	4696	4701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408235
126	NC_017559	CTG	2	6	4753	4758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408235
127	NC_017559	ACG	2	6	4769	4774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408235
128	NC_017559	ATC	2	6	4780	4785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408235
129	NC_017559	TCG	2	6	4796	4801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408235
130	NC_017559	CG	3	6	4806	4811	0 %	0 %	50 %	50 %	523408235
131	NC_017559	CG	3	6	4824	4829	0 %	0 %	50 %	50 %	523408235
132	NC_017559	CGC	2	6	4849	4854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408235
133	NC_017559	TCG	2	6	4937	4942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408235
134	NC_017559	GGC	2	6	4957	4962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408235
135	NC_017559	GC	5	10	5034	5043	0 %	0 %	50 %	50 %	523408235
136	NC_017559	CCAG	2	8	5060	5067	25 %	0 %	25 %	50 %	523408235
137	NC_017559	TCA	2	6	5081	5086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408235
138	NC_017559	GAC	2	6	5113	5118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408235
139	NC_017559	ACC	2	6	5141	5146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408235
140	NC_017559	CAT	4	12	5148	5159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408235
141	NC_017559	GCT	3	9	5196	5204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408235
142	NC_017559	TTC	2	6	5209	5214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408235
143	NC_017559	ATC	2	6	5233	5238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408235
144	NC_017559	GCC	2	6	5265	5270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408235
145	NC_017559	GAC	2	6	5314	5319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408235
146	NC_017559	GC	3	6	5373	5378	0 %	0 %	50 %	50 %	523408235
147	NC_017559	CG	3	6	5438	5443	0 %	0 %	50 %	50 %	523408235
148	NC_017559	CG	3	6	5462	5467	0 %	0 %	50 %	50 %	523408235
149	NC_017559	TGCGC	2	10	5481	5490	0 %	20 %	40 %	40 %	523408235
150	NC_017559	TC	3	6	5517	5522	0 %	50 %	0 %	50 %	523408235
151	NC_017559	GCC	3	9	5530	5538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408235
152	NC_017559	CTG	2	6	5569	5574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408235
153	NC_017559	CGG	2	6	5604	5609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408235
154	NC_017559	ACG	2	6	5636	5641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408235
155	NC_017559	GCG	2	6	5673	5678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408235
156	NC_017559	GCG	2	6	5799	5804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408235
157	NC_017559	GCT	2	6	5865	5870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408235
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159	NC_017559	ACC	2	6	5947	5952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408235
160	NC_017559	GCC	2	6	5969	5974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408235
161	NC_017559	GCG	2	6	6004	6009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408235
162	NC_017559	ACG	2	6	6022	6027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408235
163	NC_017559	CGA	2	6	6036	6041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408235
164	NC_017559	CGG	2	6	6052	6057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408235
165	NC_017559	TGG	2	6	6080	6085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408235
166	NC_017559	TCAT	2	8	6554	6561	25 %	50 %	0 %	25 %	523408236
167	NC_017559	TC	3	6	6567	6572	0 %	50 %	0 %	50 %	523408236
168	NC_017559	CGG	2	6	6587	6592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408236
169	NC_017559	CGTC	2	8	6615	6622	0 %	25 %	25 %	50 %	523408236
170	NC_017559	GGA	2	6	6645	6650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408236
171	NC_017559	TGT	2	6	6660	6665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408236
172	NC_017559	TGC	2	6	6692	6697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408236
173	NC_017559	CAG	2	6	6709	6714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408236
174	NC_017559	CTT	2	6	6757	6762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408236
175	NC_017559	GTCAA	2	10	6808	6817	40 %	20 %	20 %	20 %	523408236
176	NC_017559	CGAAG	2	10	6936	6945	40 %	0 %	40 %	20 %	523408236
177	NC_017559	TGCT	2	8	7016	7023	0 %	50 %	25 %	25 %	523408236
178	NC_017559	CATC	2	8	7059	7066	25 %	25 %	0 %	50 %	523408236
179	NC_017559	CG	3	6	7103	7108	0 %	0 %	50 %	50 %	523408236
180	NC_017559	CGA	2	6	7143	7148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408236
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182	NC_017559	TTG	2	6	7274	7279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408236
183	NC_017559	TGC	2	6	7373	7378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408236
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188	NC_017559	CG	4	8	7666	7673	0 %	0 %	50 %	50 %	523408237
189	NC_017559	TGGG	2	8	7788	7795	0 %	25 %	75 %	0 %	523408237
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192	NC_017559	CAG	2	6	7916	7921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408238
193	NC_017559	CT	3	6	7965	7970	0 %	50 %	0 %	50 %	523408238
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196	NC_017559	CG	3	6	8119	8124	0 %	0 %	50 %	50 %	523408238
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200	NC_017559	CG	3	6	8301	8306	0 %	0 %	50 %	50 %	523408239
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242	NC_017559	GCT	2	6	10000	10005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408240
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247	NC_017559	GCACG	2	10	10266	10275	20 %	0 %	40 %	40 %	523408240
248	NC_017559	CAG	2	6	10327	10332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408240
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250	NC_017559	TCC	2	6	10392	10397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523408240
251	NC_017559	GCA	2	6	10409	10414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408240
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253	NC_017559	AGA	2	6	10488	10493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408240
254	NC_017559	CGG	2	6	10623	10628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408240
255	NC_017559	CTC	2	6	10809	10814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523408240
256	NC_017559	CCG	2	6	10817	10822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408240
257	NC_017559	GCT	2	6	10929	10934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408240
258	NC_017559	ACG	2	6	10936	10941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408240
259	NC_017559	AGCC	2	8	10949	10956	25 %	0 %	25 %	50 %	523408240
260	NC_017559	GGT	2	6	10978	10983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408240
261	NC_017559	TGC	2	6	10989	10994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408240
262	NC_017559	CAG	2	6	11113	11118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408240
263	NC_017559	CGTA	2	8	11158	11165	25 %	25 %	25 %	25 %	523408240
264	NC_017559	GGTA	2	8	11178	11185	25 %	25 %	50 %	0 %	523408240
265	NC_017559	TAC	2	6	11228	11233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408240
266	NC_017559	GA	3	6	11256	11261	50 %	0 %	50 %	0 %	523408240
267	NC_017559	GCG	2	6	11455	11460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408240
268	NC_017559	GAC	2	6	11467	11472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408240
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290	NC_017559	T	6	6	12528	12533	0 %	100 %	0 %	0 %	523408241
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294	NC_017559	GAC	2	6	12769	12774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408241
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298	NC_017559	TGA	2	6	13067	13072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408241
299	NC_017559	GCG	2	6	13214	13219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408241
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